関連リンク集

弊社所属の科学者および共同研究者によって編纂された、ゲノミクス領域やプロテオミクス領域の有用なサイトへのリンク集を紹介します。同時に、より広範な科学的関心にお答えするため、研究資料としても使用可能なサイトへのリンクも含まれます。

このリンク集は、これで完成したわけではありません。皆様の研究を支援し、皆様が効率的に弊社関連領域の情報へアクセスできるよう、さらなる調整を予定しています。ご提案がおありでしたら、webmaster@illuminakk.co.jpまでお知らせください。

弊社では、リンク数を問うのではなく、有用なサイトへのリンクを重視します。ゲノミクスやプロテオミクス，分子生物学に関連する包括的なリンク集としては、Amos' WWWリンクページ (http://www.expasy.org/links.html) をお勧めします。

科学論文

Pubmed
医学や生物学関連領域に関する最新のデータベースで、1969年まで資料をさかのぼることができます。
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed

国際HapMapプロジェクト
http://www.hapmap.org/
Human Genome Project
http://www.genome.gov/
Central Dogma Basics
http://www.johnkyrk.com/DNAanatomy.html
OMIM (Mendelian Inheritance in Man)
メンデル性遺伝様式を示す疾患に集中したヒト遺伝子のデータベースです。
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=OMIM
Human Gene Mutation Database
ヒト突然変異のデータベースです。
http://www.hgmd.org

123 Genomics
ゲノミクスとバイオインフォマティクスの基本的な知識を得ることができます。
http://123genomics.com
Entrez nucleotide
一般に公開されているほぼ全てのDNA塩基配列にアクセスすることができます。
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=Nucleotide
Entrez Protein
一般に公開されているほぼ全てのたんぱく質のアミノ酸配列にアクセスすることができます。
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=Protein
Entrez Entire Genomes
一般に公開されているゲノムの塩基配列やマップ，検索ツールを利用できます。
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=Genome
微生物のゲノミクス
完了したまたは進行中の微生物ゲノムに関する包括的なディレクトリーです。
http://www.tigr.org/tdb/mdb/mdbcomplete.html
UNIGENE
様々な生物種の非重複・遺伝子セットを確認できます。ヒトおよびマウス、ラット、ゼブラフィッシュが含まれます。
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/UniGene/

NCBI BLAST
あらゆる公共のデータベースからタンパク質またはDNAの配列ホモロジーを検索できます。
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/
ORF finder
DNA塩基配列にコードされているORF（読み取り枠）を視覚的に表示し、その内容をBLASTから検索できます。
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gorf/gorf.html
Prosite Database
配列を入力すれば、機能的ドメインを検索できます。
http://www.expasy.org/prosite/
Pfam Db
配列を入力すれば、統計的にマッチする機能的ドメインを検索できます。
http://www.sanger.ac.uk/Software/Pfam/
PSORT protein localization
タンパク質の細胞内局在性を予測できます。
http://psort.nibb.ac.jp/

TIGR ソフトウェア
http://www.tigr.org/softlab/
Microarrays.org ソフトウェア・リンク集
http://derisilab.ucsf.edu/microarray/software.html
MIT Genome Center FTP アーカイブ・ソフトウェア
http://www.genome.wi.mit.edu/ftp/distribution/software/
Sanger Centre ソフトウェア・アーカイブ
http://www.sanger.ac.uk/Software/