最も小さな生物の詳細なゲノムビューを取得します。小規模ゲノムシーケンスは、公衆衛生、疫学、疾患研究のための微生物またはウイルスゲノムの包括的な解析を提供します。MiSeqランあたり最大24の小さなゲノムをシーケンスします。
微生物ゲノミクス研究のためにMiSeqシステムで他の研究者がどのように小規模ゲノムシーケンスを使用しているかをご覧ください。
90分/15分のハンズオン
DNAローインプット要件で、小規模ゲノムPCRアンプリコンおよびプラスミド用のシーケンス対応ライブラリーを90分未満で調製します。
ヒト全ゲノムシーケンスからアンプリコン、プラスミド、微生物の種まで、広範囲のアプリケーション用の迅速な統合ワークフロー。
56時間/15分のハンズオン
以前のキットバージョンと比較して、クラスター密度とリード長を増加させ、シーケンス品質スコアを向上させるために 化学を最適化。
3時間
デノボシーケンス用のオープンソースツールで、MDAシングルセルおよび標準細菌データセットから小さなゲノムを組み立てるように設計されています。
Tell-ReadおよびTell-Linkアプリは、de novo WGSのアセンブリの読み取りと作成を行います。
Basespace Sequence Hubのサンプルデータを閲覧する(ログインが必要):
MiSeq小ゲノムデータ
*MiSeqシステム上の小さな全ゲノムシーケンスは、5 Mbゲノム、50-100Xカバレッジ、2 x 300 bpリード長、Nextera XT Library Prep Kit、MiSeq Reagent v3 600サイクルキットに基づく、2016年に計算されたサンプルあたりの推定コストです
ターゲットリシーケンスは、研究対象の遺伝子 またはゲノム領域のサブセットのみのシーケンスに時間、費用、および解析を集中させます。PCRアンプリコンの超ディープシーケンスであるアンプリコンシーケンスは、1回のアッセイで数百ものターゲットゲノム領域の費用対効果の高い解析を可能にします。1回のMiSeqランで最大96サンプルおよび1536アンプリコン以上のシーケンスが可能です。
5~7時間
一回の実行で数種~数百種の遺伝子を範囲とするターゲットに使用するための、高度にマルチプレックス化されたポリメラーゼ連鎖反応(PCR)に基づくワークフロー
17~32時間
MiSeqシーケンス試薬は、充填済みですぐに使用できるカートリッジに入っています。低出力アプリケーションには マイクロフォーマットとナノフォーマットが利用可能です。
3時間
シーケンスランの作成、ランのステータス監視、データ解析のためのオンプレミス型ソフトウェアソリューションです。
NGSデータの解析と管理を行うイルミナのゲノミクスクラウドコンピューティング環境。
研究者がヒトゲノムデータから生物学的に重要なバリアントを迅速に同定できるようにします。
16SリボソームRNA(rRNA)遺伝子のシーケンスは、複雑な微生物叢や研究が困難な環境からの細菌を同定して比較するための培養不要の手法です。当社の 16S rRNAシーケンスの実証 済み プロトコール は、お客様の実験から推測を排除するのに役立ちます。マルチプレックスでは、MiSeqランごとに最大96サンプルをシーケンスできます。
他の研究者がどのようにMiSeqシステムを使用してメタゲノミクス研究を強化しているかをご覧ください。
3時間/30分のハンズオン
Nextera XTインデックスキットでは、1回のシーケンスランで最大384のユニークにインデックス化されたサンプルをプールしてシーケンスすることができます。
56時間/15分のハンズオン
以前のキットバージョンと比較して、クラスター密度とリード 長を増加させ、シーケンス品質スコアを向上させるために最適化された ケミストリー。
3時間
GreenGenes分類学的データベースのイルミナ精選版を用いて、16S rRNAターゲットアンプリコン解読の分類学的手法を実施します。
BaseSpace Sequence Hubのサンプルデータを閲覧する(ログインが必要):
16Sメタゲノムシーケンスラン
16Sメタゲノムシーケンスプロジェクト
*MiSeqシステム16S rRNAシーケンスは、96サンプル、2 x 300 bpリード長、Nextera XTインデックスプライマー、MiSeq Reagent v3 600サイクルキットに基づく、2016年に計算されたサンプルあたりの推定コストです
ハイスループットシーケンスは、Deakin Genomics Centerで農業、水産養殖、生物多様性、保全研究をサポートする道を切り開いています
インタビューを読むBeadChipアレイから、ゲノム、トランスクリプトーム、またはエピゲノム研究のためのライブラリーの準備、シーケンサーの選択、解析、サポートまで、すべて1か所で必要な情報にアクセスできます。研究用途に応じて特別に設計された包括的なガイドを使用して、ラボに最適なツールを選択してください。
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