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シーケンスアプリケーション: ゲノム解析

リード長とペアエンド法を兼ね備えたイルミナの次世代シーケンサーシステムでは、多彩なゲノムシーケンス解析が行えます。安定したシーケンスケミストリーがもたらすリード長により、研究のニーズに合わせた実験デザインを組むことができます。

100bpリードでも優れた精度をもたらすイルミナのシーケンスでは、シングルエンド、ペアエンド(短鎖インサート)、メイトペア(長鎖インサート)法を選ぶことができます。全ゲノムシーケンスやSNP探索、コピー数解析、染色体転座など、アプリケーションに応じたライブラリー作成が可能です。

全ゲノムリシーケンス

次世代シーケンサーのスループットが拡大するに従い、ヒトゲノムリシーケンスもルーチンで行うことが可能となりました。これまでにもイルミナ次世代シーケンサーを用いた数多くのヒトゲノムリシーケンスの論文が発表されています。

大規模なヒトゲノムリシーケンスにご興味がある研究者は、イルミナのGenome Networkをご利用いただけます。


ターゲット領域リシーケンス

微量DNAからスタートできるイルミナの次世代シーケンサーシステムでは、幹細胞や小さな生物種、培養が難しい生物種といったDNA量が限られているサンプルからでもシーケンス解析が可能です。さらにターゲット領域を絞ったシーケンスを行えば、コスト効率よく変異検出が行えます。

ヒトエクソーム解析には、新発売のエクソームエンリッチメントキットをご利用ください。


De Novo シーケンス

  • ペアエンドおよびメイトペア法:インサートサイズに幅を持たせたライブラリー調製は、より長いスキャフォールドと精度の高いコンティグを構築します。
  • リード長:ゲノムサイズの大きい生物種でも、100bpを超えるリード長により解析がしやすくなります。
  • 生データの精度:Q35を超えるデータの品質と高いパーフェクトマッチを誇るリードから得られるコンティグはより精度の高い配列になります。
  • アセンブルツール:VelvetやEULER-SR、SSAKEなどイルミナの次世代シーケンサーを基に開発されたアセンブルツールがお使いいただけます。