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Infinium HumanMethylation27 BeadChip

HumanMethylation27 BeadChip はゲノムワイドなメチル化DNA解析のための効率の良いソリューションを提供します。イルミナの革新的なInfinium Methylation Assayにより、サンプルあたり27,578の重要なCpGサイトを1塩基の解像度で解析することができます。1回のアレイで12サンプルまで同時解析可能な高いスループット、そしてわずか500ngのDNA量の特長があります。正常細胞および疾患細胞でのメチル化DNAの生物学的な役割を解明するツールとして、また新たなDNAメチル化マーカーの探索のツールとしても、お使いいただけます。GenomeStudio ソフトウエアにより、異なるサンプルにおけるメチル化プロファイルの結果比較、また遺伝子発現プロファイルとの比較解析が可能です。

ターゲットメチル化領域

HumanMethylation27 は、NCBI CCDSデータベース(Genome Build 36)に登録されている14,475遺伝子(CCDS: Consensus Coding Sequence)の転写開始調節を担うプロモーター領域のCpGサイトをターゲットとしています。27,578サイトのうち、254サイトは110のmiRNAプロモーターをターゲットとしてデザインされています。CCDS遺伝子ごとに平均2つのサイトを、また200以上の癌関連遺伝子あるいはインプリント遺伝子には、遺伝子あたり3〜20のCpGサイトから選択しています。

特長

  • 高い解像度:14,000以上の遺伝子から27,578のCpGサイトを1塩基の解像度で解析
  • ハイスループット:1枚のBeadChipで12サンプル同時実験のマルチサンプルフォーマット
  • 確立されたアッセイ:PCRを必要としないInfiniumアッセイ
  • 少ないサンプル量:わずか500ngから実験スタート(バイサルファイト処理前)
  • 高品質データ:テクニカルの繰り返しで0.98以上の再現性
  • 統合されたデータ解析:GenomeStudioで解析サポート、遺伝子発現データとの統合解析も可能