MaizeSNP50 BeadChip
MaizeSNP50 BeadChipは、高品質なトウモロコシの全ゲノムジェノタイピングをコスト効率よくおこなうことができるマイクロアレイです。アレイには、B73 reference sequenceをもとにデザインされた検証済みの一塩基多型(SNP)56,110プローブを搭載しています。イルミナはこのBeadChipを TraitGenetics、フランス国立農学研究所およびシンジェンタと共同開発しました。SNPコンテンツのデザインには、複数の公共および私的データベースの情報が利用されています。
このMaizeSNP50 BeadChipに搭載されている高度に多様性のあるSNPコンテンツは、30以上のトウモロコシ品種を使った機能テストをうけています。重要なことは、このBeadChipにはMbあたり平均25マーカー以上が搭載されており、全ゲノムジェノタイピング研究に十分なSNP密度を備えていることです。これらのマーカーセットは、遺伝地図の作成やマーカーを利用した育種にも利用できます。
MaizeSNP50 BeadChipには、非常に高いコールレートと柔軟性のあるコンテンツデザインが可能なInfinium HDアッセイを採用しています。
- PCRやライゲーション反応を必要としない1チューブでおこなうアッセイにより、労力やサンプルハンドリングエラーを削減
- 同時に24サンプル処理できるマルチサンプルフォーマット

