Illumina iControlDB

iControlDBとは

近年コントロール群とケース群を比較する全ゲノム関連解析法が広く使われるようになりました。Illuminaではお客様のために、関連解析におけるコントロールサンプルとして使えるジェノタイピングと表現型のデータをご提供しています。このコントロールを使うことで、ある特定の疾患を持つケース群と、疾患を持たないコントロール群の比較および解析に役立てることができます。iControlDBは、このようなコントールサンプルのデータを集めた、オンラインデータベースです。iControlDBにあるデータを適切に、効果的にお使いいただくことで、さらなる研究の発展が可能となりました。

iControlDBへのデータのアップロード

iControlDBにデータをアップロードするためには、パスワード設定を必要とするiComというIlluminaウェブサービス（Illumina製品をお使いのお客様を対象としたサービス）への登録が必要です。また、Illumina iControlDB Submission Agreement(英語PDF)にある諸条件を理解し、確認いただきます。データアップロード時には、所属される機関（倫理委員会など）においてデータアップロードに必要となる承認を書式化したものを必ず提出いただきます。

iControlDBへログオンした後は、Illumina BeadStudio解析ソフトウェアから直接データをアップロードすることができます。Illuminaでは、最初にデータアップロードする際に、iControl DB Test Application(ZIP)をダウンロードし、お客様のコンピュータ上にインストールしテストすることを推奨しています。このテストでは、インターネット環境がデータアップロードプロセスに適しているかを確認します。データのアップロードに関する詳細はiControlDB User Guideをご参照ください。

最低限の表現型情報として、性別、年齢、民族の情報が必要となります。

iControlDBからデータを検索しダウンロード

iControlDBから表現型をもとにした検索とデータのダウンロードにも、パスワード設定を必要とするiCom というIlluminaウェブサービス（Illumina製品をお使いのお客様を対象としたサービス）への登録が必要です。データダウンロードに際しては、Illumina iControlDB Download Agreement(英語PDF)を読み、内容を理解ください。このiControlDB Download Agreement(英語PDF)およびPurpose Document(英語PDF)に記載された目的にのみダウンロードしたデータはお使いいただけます。データベースへは、iControlDB-Clientというクライアントソフトウェアを介してログオンします。このソフトウェアではデータベース内にあるデータを表現型情報に基づいてフィルターし、検索することができます。検索後は、選択したコントロールサンプルのデータセットをダウンロードすることができます（現在のところ、生データである強度データは提供しておりません）。

データベースの詳細についてはPurpose Document(英語PDF)をご参照ください。また、こちらにはジェノタイピングと表現型のiControlDBへのデータアップロードに関して必要な同意や承認についても記載されていますので、注意深くお読みください。